Könnte es vielleicht damit zusammenhängen:
Alle Dateien, die man importiert, werden irgendwie protokolliert.
Wenn man also die Dateien in den Ordner reinkopiert, statt zu importieren, kann natürlich nichts protokolliert werden.
Irgendwann kommt der RPG Maker dann durch ungüngstige Verkettung von Ereignissen, mit den Ressourcen durcheinander und zeigt uns diese Fehlermeldung. Alles nur Theorie, bewiesen ist nichts.