Ich hab mal ein Tileset komplett selbst gepixelt (das Wasteland-Tileset das man im Atelier runterladen kann), war ne Heidenarbeit, und du wirst nie fertig wenn du alle Tilesets allein machen willst. Schau dir lieber auf den verschiedenen RPG-Maker-Seiten die Ressourcen an, such dir die Teile raus die du brauchen kannst und die zum Grafikstiel deines Spiels passen und bau dir daraus ein Set zusammen.

Ich würde empfehlen etwas Ordnung zu halten, z.B alle Bodentiles ganz oben im Set unterbringen, dann Wände, dann Objekte, damit nicht alles durcheinander ist. Sonst musst du andauernd hoch und runter scrollen, und das ist nervig. Lass in den einzelen Bereichen immer noch etwas Platz, falls du später noch ein paar teile einfügen musst.

So würde ich es zummindest machen.