Klingt soweit ganz gut, du darfst beim Call Script afaik keinen Absatz machen.
Code: 
$game_variables[1] = $game_screen.pictures[1].x.to_i
Code: 
$game_variables[2] = $game_screen.pictures[1].y.to_i
Kopier das genau so in den Call Script Bereich ohne selbst einen Absatz zu machen (der Editor selber macht das aber).
Dann ersetze die Zahlen mit der Variable die du hast bzw. der Picture ID die du entnehmen willst. Bei mir klappt's jedenfalls.