Ich sehe das so, dass in der ursprünglichen Fassung mehr drin war. Letztendlich wird nie erklärt, warum Team Rocket Mr. Fuji entführen will oder warum sie hinter dem Meisterball her waren. Ich denke eben, dass diese Informationen rausgenommen wurden oder der Interpretation des Spielers überlassen wurden.

ABER: Ich zitiere hier mal Pokewiki.
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Mr. Fuji ist ein netter, älterer Mann, der in Lavandia lebt. Dort kümmert er sich um verwaiste Pokémon und betreibt nebenbei auch Grabpflege im Pokémon Turm. Ursprünglich stammt er jedoch von der Zinnoberinsel, wo er gemeinsam mit Pyro im Pokémon-Labor arbeitete (Das bezeugt ein Foto im Labor auf der Zinnoberinsel auf dem Mr. Fuji und Pyro zu sehen sind).
Diese Informationen stammen aber erst aus den Remakes, bestätigen allerdings, was ich oben geschrieben habe. Die Zusammenhänge zu Team Rocket kann man sich dann herleiten. Sind aber auch bestätigt, was Mewtu angeht.