Das oberste, linke Tile im Upper-Layer MUSS mit einem Stern markiert sein. Dieses Tile legt der RPG-Maker automatisch auf jedes Tile, auf dem sonst kein Upper-Layer-Tile vorhanden ist. Stellst du das Tile auf eine Kreis, ist jedes feld ohne Upper-Layer begehbar, stellst du es auf X, ist jedes feld ohne Upper-Layer gesperrt.

Das dürfte dein Problem sein.