Vermutlich refresht Eclipse nicht automatisch; den Spaß habe ich in meinem Projekt immer, wenn ich die aktuelle SVN-Revision lade (ich traue Subclipse nicht so ganz). Es gibt in diesem Fall zwei Lösungen:

1.) Projekt im Package Explorer auswählen und F5 drücken (muß nach jeder Änderung wiederholt werden).
2.) Einstellungen -> General -> Workspace -> Refresh automatically auswählen (refresht automatisch).