Also ich kann es dir nur aus Sicht des deutschen Schulsystems beschreiben.

Bei mir ist es so gewesen, dass ich durch Rückenprobleme, ab der 10. Klasse, von der Benotung ausgenommen wurde. Dies geschah zunächst nur dadurch, dass man sich von der Schulärztin/Ärztin, die im Gesundheitsamt sitzt (so einer Zweigstelle) sich ein Attest ausstellen lässt und dies als Original der Schulsekretärin gibt, für die Schülerakte, und die einfache Kopie dem Sportlehrer überreicht für die Benotungssache.
Nun habe ich allerdings nur eine Teilsportbefreiung gehabt und deswegen wurde bei mir auf die Notenvergabe verzichtet und ich habe trotzdem mit am Sport teilgenommen (Auch auf ausdrücklichen Wunsch).
Nun ging der Spaß auch so für die Oberstufe genauso weiter, also der Ablauf: Attest besorgen-->2 Kopien-->Original an Schulakte-->Kopie Sportlehrer-->Kopie für eigene Unterlagen nur musste man jetzt ein Ersatzfach angeben, um die Punkte, die man jetzt ohne Sport "verpasst" auszugleichen (obwohl man Sport im Abi sowieso nicht einbringen muss). Und dummerweise wählte ich mein Ersatzfach ab (Es war Physik). Daraufhin mussten mir dann willkürlich irgendwelche Punkte gegeben werden.
Zur Erklärung: Laut meiner Oberstufenberaterin scheint sich die Regel für die Nicht-Sportkursbeleger jedes Jahr neu zu ändern. Im letzten Jahrgang durfte man noch ein "Teilgenommen" auf das Zeugnis draufklatschen oder eben ein "befreit" (Ich habe ja weiterhin teilgenommen, nur eben ohne Benotung). Nur wurde in diesem Jahr es so gemacht, dass man nur noch Noten bekam oder es ganz abwählen müsste. Mein Sonderfall war nicht mit dabei. Deswegen kamen die Notenpunkte doch noch drauf.

@Nathrael
Ich konnte dir zwar nichts zu deiner Situation in Österreich erzählen, aber vielleicht konnte ich dir einige Eindrücke zeigen. Übrigens, könntest du bitte erzählen, wie du das meinst, dass es psychische Gründe gegen den Sportunterricht gibt? Davon habe ich bisher noch nichts gehört.