Diese "Talentsteine" bringen euch nur etwas, wenn ihr sie zur Vegan-Himmelsstätte bringt. Dort am Eingang des Katsura-Heiligtums (das Gebäude, wo der Gottdämon war) ist neben dem Speicherstein ein blaues "Drehding". Das müsst ihr einfach "ansprechen".
Komisch, dass das irgendwie kaum einen auffällt, wobei es an dieser Stelle vorher gar nicht war...

Zu Soratas "Talentstein": Den bekommt man, wenn man die Sidequest in "Eras" gelöst hat. Allerdings kommt man erst nach Eras, wenn man das finale Gebiet (mit ???? gekennzeichnet) betreten kann.

Allgemein zu den blauen Truhen: Die sind allesamt praktisch. Zumal man immer Elixiere gebrauchen kann und besonders die Mega-Elixiere nicht käuflich zu erwerben sind.

Und nein, es gibt keinen Fluchtzauber. Nur bei manchen Gebieten gibt es eine Art "Teleporter".