UVAMaps und sonstiges bestimmt, wie die Texturdargestellt wird - Also die skalierung, Form u.a. Diese Informationen bleiben natürlich im normalfall in der Modelldatei gespeichert, was auch gut so ist. Im Maker an sich kannst du dann nur die Texturen eines jeden Materials abändern, wobei diese Optionen bestehend bleiben.
Wenn du also in einem Modell deine Wand und dein Dach mit dem gleichen Material bestückst, kannst du das im Maker nicht trennen - du texturierst dort keine Flächen, sondern editierst die Materialien.