Hat hauptsächlich damit zu tun, daß nun die Oblivion-BSA-Archive ein neueres Datei-Datum haben als die Plugin-Dateien - dadurch werden sie genommen statt der installierten Alternativdateien.

Ursprünglich hätte ich dir dazu geraten, mit einem Tool wie dem Oblivion Mod Manager an den BSA's rumzubasteln. Jetzt klingt aber dieser Weg sehr vielversprechend:
http://theelderscrolls.info/?go=comments&id=1189

Probier das mal bitte aus. Theoretisch soll es dein Problem endgültig lösen, auch falls neue Patches kommen. Und das völlig ohne Neuinstallation.