Kommt denke ich mal auch stark drauf an, wie sehr der Rechner ausgelastet wird und wie viele Prozesse im Hintergrund laufen.
Hast du mal versucht, mit der Freeware Motherboard Monitor die Temperatur zu überwachen (Gibts soweit ich informiert bin keine Linuxversion für, aber es existiert sicherlich ein Pendant hierfür.)?
Bei Temperaturen über 50° wirds auf jeden Fall kritisch.