Gut ich benutze ebenfalls Gimp.
Hier eine simple Anleitung:
1. Makiere zunächst die Stelle die du transparent machen möchtest.
2. Mache einen Rechtslick und dann klicke auf "Ebene".
3. Dann auf "Tranzparenz".
4. Dannach auf "Alphakanal hinzufügen".
5. Nachdem du dies getan hast kannst du auf (Ebene/Transparenz) "Alpha-Schwellwert" klicken, wo du die Stärke der Transparenz einstellen kannst.
mfg