Wenn du mit dem Mod Manager, die mods in das omod Format konvertierst (ist ganz einfach), kannst du die mod-Dateien durch das deaktivieren des omod`s komplett entfernen.

Auftretende Probleme werden dadurch rückgängig gemacht.
Oft reicht auch schon ein Ändern der Ladereihenfolge der PI`s.

Die Nutzung des Oblivion Mod Managers wird dringend empfohlen.