Ehe du mit dem Löschen von Abilities beginnst, solltest du erstmal alle G.F zusammen haben, und dann überlegen, was du noch brauchst oder verändern willst.

Ehrlich gesagt weiß ich nicht, ob G.F-Magie/HP+X0% sich adiert, oder nur unterschiedliche Stufen erreicht, aber was du auf jeden Fall löschen kannst, sind die Befehlsabilities G.F, Draw, Zauber, Item. Diese wirst du mit jedem Charakter nur einmal brauchen, und jede G.F hat diese vier. Das gibt schonmal einiges an Spielraum. Wenn das noch nicht reicht, kannst du auch diverse, doppelt vorkommende Kopplungsabilites oder Charakterabilities löschen, wie etwa HP-K.

EL/ZU- Abwehr K ist jedoch wohl nutzlos, sofern schon x2/x4 gelernt wurde. Wenn du dir nicht sicher bist, kannst du vor dem Benutzen eines Vergissmeinnicht ja einfach mal speichern.

Bezüglich der Karten gibts irgendwo sicher eine Lösung dafür, vermutlich auch auf RPG². Allerdings gibt es nur wenige Karten, die man wirklich verpassen kann, und die sich nicht nachträglich besorgen lassen.
Wenn du möglichst früh einen Stapel guter Karten willst, solltest du möglichst früh Quezacotls Karte-Befehl lernen, und diesen auch bei den meisten Monstern mehrmals anwenden, da man so oft schon sehr früh an gute Boss-Karten wie Dormen oder Tiamat kommt. Ansonsten kriegt man schon sehr früh nach Spielbeginn die Ifrit- Karte und gegen Diabolos ebenso eine G.F-Karte. Wenn du dann schon ein paar Boss-Karten hast, kannst du dir die Xell-Karte besorgen, im Balamb Garden dann noch Quistis, in Timber gleich Angel dazu, in Dollet Siren, im Grab des unbekannten Königs die beiden Brothers-Karten usw.

Sofern es dir also darum geht, recht früh anständige Karten zu bekommen, ist das durchaus durch diese Kurzbeschreiben von mir realisierbar. Wenn du willst, kann ich das auch noch ein wenig präzisieren und ausbauen.

An Dingen, die man im Spielverlauf beachten sollte, fallen mir gerade nicht wirklich viele Dinge ein... Den Kampf-Zähler kann man z.B. verpassen, oder die Wunderlampe oder diverse Waffenmagaziene, aber von den beiden erstgenannten mal abgesehen eigentlich wenig wirklich unbedingt notwendiges, dass dann für immer futsch ist. Mir fällt gerade nichts weiter ein, aber vielleicht hat wer anderes noch eine Idee.