Für MPEG Encodierung kannst du TMPGEnc nehmen. (Der MPEG2 Encoder hat ne 20 Tage Testzeit, ansonsten ist das Tool Freeware.)

Oder aber, wenn du dich mit AVISynth auskennst, kannst du auch HC_Encoder nehmen. Dies ist ein Freeware MPEG1/2 Encoder, der ausschliesslich AViSynth Scripte lesen kann.

Oder du kaufst dir den YMPEG Encoder.
Das ist ein MPEG Encoder, der es auch ermöglicht unter VirtualDub(Mod) Und allen anderen Programmen, wo man das Video als AVI speichern kann, als MPEG zu encoden.