Du brauchst zum formatieren fdisk, das ist bei Windows 98 Startdisketten enthalten und auch bei Windows 98 bootfähigen CDs. der Befehl sollte lauten, Xformat d: - (für "X" entweder deinen Diskettenlaufwerkbuchstaben oder deinen CD-Rom-Laufwerkbuchstaben einsetzen.), du kannst natürlich die Festplatte auch unter Windows formatieren. Rechts Klick - formatieren, geht aber nur bei Nicht-System-Partitionen.
Letzteres kann ich dir leider nicht beantworten.