Mit Windows-Boardmitteln: Beide Progs starten. Dann aus CS rausswitchen, den Task-Manager öffnen und dort zur Prozeßliste gehen. Rechtsklick auf den Prozeß (Fraps.exe, CS.exe (?)), dort auf "Zugehörigkeit" klicken und im aufpoppenden Fenster jeweils einen Haken rausnehmen. (So daß z.B. bei CS "CPU 0" angewählt bleibt und bei Fraps "CPU 21.) Damit haben beide EXE's quasi einen Core für sich alleine.

Gibt noch ein paar Tools, die das wohl automatisch bzw. im Hintergrund erledigen. Auf die Schnelle habe ich das hier bei Onkel Tom gefunden:
http://www.tomshardware.com/2004/05/...ocessing_buck/
(Runterscrollen, "THG Task Assignment Manager" klicksen)

P.S. ob die Zuweisungsgeschichte praktisch so viel bringt, wie ich da oben rumgetönt habe, mußt du jetzt ausprobieren. /me hat das selbst gar nicht probiert.