Hast du die Tastatur schon an einem anderen PC ausprobiert?
Falls ja, versuch mal mit Knoppix zu booten. Sollten die Strg-Tasten dort auch nicht funzen, liegt der Fehler sehr wahrscheinlich am Mainboard.
Falls sie doch funzen, solltest du mal versuchen, mit einem Online-Virenscanner dein System zu überprüfen. AFAIR gibt es manche Viren, die gezielt wichtige Tasten blockieren, sodass man z. B. nicht mehr den Taskmanager aufrufen kann.

mfg Volldulli