Prinzipiell kannst du eine Datenbank für viele Sachen gleichzeitig benutzen!
Solange du für jedes CMS in der Datenbank ein eigenes Präfix benutzt (bei einigen kann man das bei der Installation einstellen), sollte nichts schief gehen ^^
Wenn du dasselbe CMS (warum auch immer) mehrmals installieren solltest, ohne verschiedene Tabellennamen, dann kommen die sich auf jeden Fall in die Quere ^^

Beispiel:
CMS 1:
cms1_tabelle_bra
cms1_tabelle_muh

CMS2:
cms2_tabelle_bra
cms2_tabelle_muh

Dann hättest du für jedes CMS eigene Tabellen