Wenn du anfängst und nur die Oblvion.esm geladen hast, kannst du deine Änderungen in einer neuen *.esp Datei speichern.
Wenn du weiter daran arbeitest, und deine *.esp mit in den Editor lädst, dann achte darauf, die Datei als aktiv zu markieren. Änderungen werden dann in dieser Datei gespeichert.