Ja, Die übrigen Punkte sind verfallen.
Definition:
Alle 10 Fertigkeitsverbesserungen in den Hauptfertigkeiten steigt man eine Stufe auf.
Man sollte während einer Stufe immer jeweils 10 Punkte in 2 Nebenfertigkeiten und 1 Hauptfertigkeit trainieren, um die maximalen Attributverbesserungen von 3x5 Punkten zu erhalten.

Beispiel:
Sonstige Fertigkeiten:
Wortgewandheit (Charisma) +10
Stumpfe Waffe (Stärke) +10
Hauptfertigkeit:
Schwere Rüstung (Konstitution) +10

ergibt beim Level up:
Charisma +5
Stärke +5
Konstitution +5

Wenn man zu wenig Nebenfertigkeiten trainiert, oder bei einem anstehenden Stufenaufstieg nicht schläft sondern weiter trainiert, verfallen eben ein paar Punkte.