Da hast du wahrscheinlich nicht die Konfliktzelle besucht. Kannst du einmal um Balmora herumlaufen (da wo die Warnung auftaucht am besten speichern), dann speichern und nochmal repair all machen? Das sichern des Ergebnisses geht einfacher: Geh mit der Maus in das Fenster, markiere den Text und kopiere ihn ins clipboard (ctrl-c oder über rechten Mausklick), danach nur noch hierher pasten.

Wir suchen nach so etwas (aber im Bereich Balmora, Westspalte -2,-2 bis -4,-2) :

[-2,-9]
BAD REF>>REMATCHED 9 1116 A-DI-Babymudcrab00000003 68
BAD REF>>REMATCHED 9 1117 A-DI-Babymudcrab00000004 68
BAD REF>>REMATCHED 9 1118 A-DI-Babymudcrab00000005 68

Bedeutung:
Plugin Nr. 9 und Plugin Nr. 68 haben 3 Referenzkonflikte bei den Objekt-IDs 1116 bis 1118; dabei kann es sich übrigens um völlig unterschiedliche Objekte im anderen Plugin handeln, z.B. Kreaturen im einen und Kisten, NPCs oder Pflanzen im anderen Plugin.
Über diese Plugin Nummern findest du nachher im Saves Verzeichnis (Wrye Mash) unter der Masterliste die entsprechenden Konflikt-Plugins. Wenn du einen rechtsklick auf "File" (über der Masterlist) machst und dann "copy list" auswählst, dann bekommst du eine nummerierte Liste deiner Plugins, die dann z.B. so aussieht (meine) :

Code: 
Masters for Mythos290000.ess:
001  Morrowind.esm
002  Tribunal.esm
003  Bloodmoon.esm
004  Veldion2.0.esm
005  Morrowind Advanced.esm
006  Havish.esm
007  Weapon Rotate.esm
008  Wizards Islands - Scourge of the Frost Bringer.esm  (Version 1.0)
009  Morrowind Patch v1.6.3.esm
010  Assassins Armory.esm
011  Azurian.Race-Comp-v3.2.esm
012  Beyond YsGramor v2.5.esm
013  BT_Whitewolf_2_0.esm
014  Clean The Lost Artifacts of Morrowind001.esm
015  GIANTS.esm
016  vn_economy_ItemLists.esp
017  vn_econ_itemlists_MWA182.esp
018  Ald_Ruhn_TG_Devil_Tanto_Tweak.esp
019  Stanegau Isle.esp
020  pcc_smeradon_17.esp
021  Flying Carpet.esp
022  Tales of Tel Branora.esp
023  Creature Pack 1.1.esp
024  abotWaterLife.esp
025  Clean Inscription 2.0.esp
026  Treasure Hunt.esp
027  Siege at Firemoth.esp
028  Firemoth Expanded 1.5.esp
029  acsAppoldro.esp
030  AreaEffectArrows.esp
031  Doom_Door_01.esp
032  Elemental books.esp
033  newarrows.esp
034  newarrows - crossbow realism.esp
035  SirLuthor-Tools.esp
036  Clean Wizard Staffs.esp
037  Uvirith Inside.esp
038  Nymeria's Faster Walk.esp
039  Kwerner_Complex_103.esp
040  CET_Meteoric_Steel_Mail.esp
041  Suran_Underworld_2.5.esp
042  BAR_Comp_Arya_v1.3_NoCap.esp
043  Werewolf_Evolution.esp  (Version 1.0)
044  French Maid Outfit.esp
045  Investigators_Trib.esp
046  Clean Lady Grey Boutique v2 Racial Support.esp
047  Weapon Rotate - Tribunal.esp
048  Weapon Rotate - Bloodmoon.esp
049  Weapon Rotate - Vendors.esp
050  The Undead.esp
051  Annastia V3.3.esp
052  Sils_Clothing_Vendor_v1.2.esp
053  GIANTS_Ultimate_Official_Fixes.esp
054  Clean Ultimate Clothing Mod_Skirts_v1.1.esp
055  Lothavor's Legacy.esp
056  Lothavor's Legacy BB addon.esp
057  NG_New_Carnithus'_Armamentarium.esp
058  Inferno's Island Revisited.esp
059  Scripted_Spells Copy.esp
060  Vampire_Embrace.esp
061  Clean Solstheim_Castle_v1.1.esp
062  Clean  A Tribute.esp
063  Oluhan V1.13.esp
064  MTT IV v0.79 (Leveled List Fixed).esp
065  Daedric Sorcery.esp  (Version 1.2)
066  Temp_Dwmr_gun.esp
067  Temp_longbow.esp
068  Changing Faces Replacer.esp
069  Ultimate Galleon v2.2.esp
070  Tribun_Laura_3_0.esp
071  MoragTongWritFix.esp
072  Clean Kagz Wood Elf Hair Mod.esp
073  Give your orders v13.esp
074  Woodman's Female Celeb Heads 01.esp
075  QarlsHotGirls.esp
076  Suran Archery Store_v3.0.esp
077  INDYBANK_BAK24.ESP
078  Better Bodies.esp
079  Magical Missile Ammo Mod_3.7.esp
080  Vampire Realism II.esp  (Version 2.2)
081  The Latest, Greatest Housing Mod_GOLD.esp
082  Aduls_Change_Weather.esp
083  Aduls_Change_Weather_BM.esp
084  Aduls_Arsenal.esp
085  Amulets and Rings 2.1 Upgrade A.esp
086  Assassins Armory - Bolt Rifles.esp
087  Assassins Armory - Arrows.esp
088  Assassins Armory - Unofficial Patch 7.7.esp
089  Vampire Realism II - TB Add-On.esp
090  Vampire Realism II - BM Add-On.esp
091  Amulet of Scrye.esp
092  armorer.esp
093  b_WWLteleport1_0.esp
094  Weapons of Tamriel v1.2.esp
095  Theurgist.esp
096  TheBlackMill.esp
097  MW_CultOfTheClouds_v10.esp
098  Helm of Sheogorath-LD.esp
099  3shades.esp
100  huntermodtrib.esp
101  Dulsya Isle.esp
102  VTA_TravelBM+Trib.esp
103  Vivec Expansion 2.0.esp
104  Clean SCastle_LoKKen_Patch.esp
105  chemwar.esp
106  More_Tresure.esp
107  TRIB_witchgirladvent1.esp
108  t_lostheir.esp
109  Bloated Morrowind.esp
110  Haunted Tombs v1.05.esp
111  BAR_BB_dresspack.esp
112  BetterBooks_AlchFormfix.esp
113  FrontierTradePost.esp
114  The Black Book of Alchemy 2.0.esp
115  Tenience's Rare Items V2.1.esp
116  Moons_Spawn_V1.3.3_Non_Patched.esp
117  Lumi_DaedricTools.esp
118  Ice_GownOfAzura.esp
119  EBQ_Artifact.esp
120  AragonWizardClothes-v12.esp
121  bcsounds.esp
122  AltMeleeMissiles.esp
123  Alchemy Improvement.esp
124  Alchemists Complete Formulary v1.1.esp
125  Loincloth_top_ pkg2.esp
126  Cali's_BB_V.2_Tight_Dresses.esp
127  CDR_Thin_Clothing_mod.esp
128  TribIntegration.esp
129  WholeStorm's RobePack.esp
130  lgnpc_AldVelothi.esp
131  lgnpc_GnaarMok.esp
132  lgnpc_HlaOad.esp
133  lgnpc_khuul.esp  (Version 1.16)
134  lgnpc_MaarGan.esp
135  lgnpc_SN.esp  (Version 0.20)
136  Tales of the Bitter Coast.esp
137  Sullen's Foxhole.esp
138  Of Human Bondage.esp
139  Illuminated Order v1.0.esp
140  Balance - NPC Spellcasting.esp
141  Free Havish - Scimitar.esp
142  Thief Experience Overhaul 1.3b (Tribunal) (Combined).esp
143  Dodge Mod 1.2-WD (Enhanced-LD) (Tribunal).esp
144  SSlave_Companions.esp
145  Weapon Range Balance.esp
146  laura_vembrace_fix.esp
147  farrp_WeaponCompilationMod_V2.esp
148  pcc_smeradon_patch_04.esp
149  pcc_extended_smeradon_21.esp
150  Clean Village Of Mora Uvirith.esp
151  Clean Just Face It v2.0.esp
152  Clean SR_Elves.esp
153  Qarls_Hot_Girls_III.esp
154  GCD - Cult of the Clouds patch.esp
155  GCD_SS_patch.esp
156  MaGISTraTe's MagesGuild Rewards 2.0.esp
157  GIANTS Ultimate Control file.esp
158  EMaTa_lights.esp
159  GCD TEO compatibility patch.esp
160  FTG.esp
161  GiftExchange1.0.esp
162  ImprovedTeleportation2.0.esp
163  ale_clothing_v0.esp
164  Trib_Domehome1.esp
165  IlluminatedWCustom2.esp
166  Lights_300_V4.esp
167  1gr_Comp_Beryl.esp
168  Rae.esp
169  ExoticsBoutiqueNoMusic.esp
170  Clean Suran Extended.esp
171  Expanded Sounds.esp
172  Wizards_Islands_SotFB_Patch.esp
173  Improved Skilled Magicka.esp
174  Armors_merged.esp
175  Creatures.esp
176  ale_clothing_v1.esp
177  Clean Aldanna Isle.esp
178  Dragonbone Armor [v.1.2].esp
179  GCD_Havish_patch.esp
180  GCD_WE_patch.esp
181  Vampire Realism II - VE Patch.esp
182  Skaal Home 2.2.esp
183  The Hidden Pathway 2.0.esp
184  Haldenshore_1.2.esp
185  constance1_0.esp
186  Booty.esp
187  daedric scimtar.esp
188  Lich Father Act I.esp
189  abotWhereAreAllBirdsGoing.esp
190  Wizards_Islands_FPS_Fix.esp
191  Illuminated Windows - Bloodmoon v1.2.esp
192  Illuminated Windows v1.3.esp
193  RD_wands.esp
194  Better Cursed Items.esp
195  Webspinner_V2_1.esp
196  The Ebony Blade V1.02.esp
197  Wizards_Islands_BM_Patch.esp
198  Horror Mod.esp
199  acsSunsiBBShirt.esp
200  LGNPC_Tel Mora_v1.02.esp
201  Illuminated Order v1.0 - Bloodmoon Compatibility Extras.esp
202  Lich Father Act II.esp
203  Steinthor_Hall_v.1.esp
204  Ald-Vendras_V31-LoKKen-SC.esp
205  BY_Patch_L1.5.esp
206  yairuns_moon.esp
207  MW_Adv_req_CM_Partners28.esp
208  Clean McGuinn Armors.esp
209  propylons1.1.esp
210  Deus Mallei v1_0.esp
211  town_of_uvirith.esp
212  Vampire_Werewolf.esp  (Version 1.2)
213  ASH 2.0.esp
214  Vampiric Hunger Base.esp
215  Vampiric Hunger Extended.esp
216  Vampiric Hunger - SU.esp
217  TachyonCastingUnlimited Copy.esp
218  VampiricIllusion.esp  (Version 1.4)
219  VampiricIllusion_MWSE_AddOn.esp  (Version 1.4)
220  ScentOfBlood_VR_MWSE.esp
221  MWSE NPCenhanced.esp
222  Fixes_Merged4.esp
223  BT_Lokken_child1.esp
224  Join All Houses.esp
225  LGNPC - Foreign Quarter v0.5.esp
226  LGNPC - Pelagiad.esp
227  InventoryHelpers.esp
228  BPC_merged_1.2.esp
229  Castle_Dragonfall.esp
230  Wayfarer's Rest v1.21.esp
231  Bloody Oath_v1.0.esp
232  VH_Bloodreport.esp  (Version 1.0)
233  ShortRangeTeleport.esp
234  EcoAdj(Sri+Ingredients).esp
235  EcoAdjDaedricDrops.esp
236  Tejón's Game Settings.esp
237  Mournhold Expanded.esp
238  Morrowind Crafting 2-0.esp
239  MWInhabitants Freeform (Vol 1).esp
240  HG Armour Balance.esp
241  PL Balance Adjustments 2.esp
242  GCD_108_PotionsScrolls.esp
243  MW_Children_1_0.esp
244  Morrowind Crafting Equipment.esp
245  bgBalancing2_EV.esp
246  vn_lichcraft2_alt.esp
247  Wanderers of Solstheim.esp
248  Galsiahs Character Development.esp
249  GCD StartScript for Trib or Bloodmoon.esp
250  GCD Over 60 level speedup.esp
251  Merged_Objects.esp
252  Clean Restored Artifacts.esp
253  Mashed Lists.esp