Verzeichnisstruktur A:
CProgramme\Bethesda Softworks\Morrowind
-(Data Files)
-(Saves)
-(... weitere Verzeichnisse)
-Morrowind.exe
-Morrowind Launcher.exe
-TES Construction Set.exe
-Morrowind.ini
-Warnings.txt
-...weitere Dateien

Verzeichnisstruktur B verhält sich gleich, nur dass die "root" anders aussieht, z.B.
DProgramme\Bethesda Softworks\Morrowind
CProgramme\Bethesda Softworks\Morrowind-EV

Die ausführbaren Dateien (.exe) gucken immer in das Verzeichnis, in dem sie liegen. D.h. der Morrowind Launcher.exe aus A holt sich die Plugins aus dem /Data Files Ordner, in dem der Morrowind Launcher.exe auch liegt. Er holt sich die Saves aus dem /Saves Ordner, in dem er liegt. So ist es bei meinen Mehrfachinstallationen.

Mit einem Rechtsklick auf die Verknüpfung (Eigenschaften) findest du heraus, aus welchem Verzeichnis sich eine ausführbare Datei die saves bzw. Plugins holt: Immer daher, wo die verknüpften .exe liegen.