Diese Fehlermeldung kann ignoriert werden. Es bedeutet nur, dass die plugins mit einer anderen Version erstellt wurden (z.B. ohne Tribunal, ohne patch etc.), kein Problem. Man könnte die entsprechenden Plugins in den Editor laden und abspeichern, aber das sollte man höchstens vor einem Neustart machen und irgendwann ab 300 Plugins lässt man das auch nach.
In deinem Morrowind Verzeichnis findest du eine Text Datei "Morrowind.ini". Trage da am besten gleich ein (irgendwo am Anfang eine Zeile zwischenschieben) :
AllowYesToAll=1
Danach bekommst du einen "Abbrechen" Knopf bei den Fehlermeldungen, womit man nur noch einmal klicken muss und alles danach gleich mit bestätigt wird.
Welche Sprachversion hast du denn?