Kopier die komplette Morrowindinstallation. Dann uninstalliere, und installiere neu.
Alternativ: Lösch (z.B. mit dem Programm "Regcleaner") die vorhandenen Morrowind - Registryeinträge.
Wenn du hingegen nur eine zweite Installation zu Testzwecken und keine komplett neue brauchst, einfach (wie oben geschrieben) nur kopieren.