Normalerweise muß man bsa-Archive gar nicht entpacken, sondern nur in der Morrowind.ini eintragen. Das kann man z.B. manuell tun, indem man dort den Eintrag an passender stelle reinschreibt:

Code: 
[Archives]
Archive 0=Tribunal.bsa
Archive 1=Bloodmoon.bsa
...
Anstelle der Punkte dann halt sowas wie Archive 2=NeueBsa.bsa reinschreiben, je nachdem wie das File heißt. Die Datei muß übrigens im DataFiles-Ordner liegen.

Beim Link oben gibt es auch das Tool BSAreg. Das kommt in den DataFiles-Ordner und erledigt das Eintragen per Doppelklick für dich.

Note: Wenn das PI nur aus eiem BSA besteht, ist es wahrscheinlich ein Texturepack oder ähnliches - irgendwas, das kein .esp oder .esm braucht. Denn die lassen sich afaik nicht aktivieren, wenn sie in einem BSA stecken.