Die Theorie mit der Illusion, halte ich auch für am wahrscheinlichsten, das wäre logischer als die andere Theorie.
Zu deiner Theorie mit den Komponenten im Körper die EMPs auslösen können, irgendwie etwas aus der Luft gegriffen oder ?

Dann müsste es ja Morpheus auch können rein theoretisch, Smith hat ja auch versucht ihn zu infizieren.
Wie gesagt, die Matrix in der Matrix Theorie ist für mich eigentlich die beste im Moment und ich kann es mir auch nicht anders vorstellen, alles was der Architekt gesagt hat, lässt sich so interpretieren.