Dazu fällt mir noch ein Trick ein, um bestimmte Texturen zu bestimmten Mods wieder loszuwerden:
Man entpacke das loszuwerdende Plugin in einen neuen Ordner, gehe in den neuen Texturen Ordner, markiere alle Files, kopiere sie in den Morrowind/Data Files/Textures Ordner (mit Überschreiben) und nun hat man alle überschriebenen Texturen im Morrowind/Data Files/Textures damit gleichzeitig markiert -> Entfernen ausführen und damit sind sie sauber herausoperiert.