Ob es an der Reihenfolge liegt, kann ich so nicht sagen, keine Ahnung. Auf jeden Fall sind es ja zwei Quests zum Abschließen. Du kannst ja mal vorsichtshalber einen Sicherheitssave anlegen (kann nie schaden) und dann mal diese Konsolenbefehle ausprobieren:

Journal HR_CalderaDisrupt 100

Dieser sollte die Mission mit dem Ebenerzabbau abschließen. Falls die Aufgabe mit den Beweisen auch immer noch als "offen" geführt wird, versuch's zusätzlich noch mit:

Journal HR_CalderaCorrupt 100

Und dann probier mal, ob du so weiterspielen kannst...