Bei http://chip.de gibts einen sehr guten Video-Converter.
Gib einfach bei suchen "Super" ein (das Ding heißt halt so ;_ .
Du kannst die Dateien auswählen und der Konvertiert dir die alle hintereinander ohne das du jedesmal was klicken musst

€dit:
Hab den Link ma rausgesucht:
http://www.chip.de/downloads/c1_downloads_17370353.html