In dem Fall war es eine Katze, allerdings war das da, weil sie etwas in der Matrix geändert haben - die Fenster entfernt.

Deine Theorie, würde bedeuten, dass der "Erste" auch ein Auserwählter gewesen sein muss, da z.B. Trinity, die Matrix nicht nach belieben verändern kann.
Der "Erste" könnte durch einen Fehler in der Matrix entstanden sein, das halte ich nicht mal für so absurd, allerdings wäre IMHO ein Kurzschluss an seinen Anschlüssen schon eine etwas niveaulose Erklärung von den Wachowski Brüdern.