Es liegt sehr wahrscheinlich am Netzteil.
Das durchschn. 350 Watt-NT hat zwischen 12 und 15 A, und der USB-Controller benötigt 5x0,5A=2,5A. Das sind etwa 20% der Gesamtleistung und reicht auf jeden Fall aus um den PC ins Stocken zu bringen.
Dass dein PC bei der neuen GraKa ganz abgestürzt ist, liegt daran dass sie mehr als 2,5A braucht.^^

Meine Empfehlung: Kauf dir ein Netzteil mit mehr als 15A. Das kostet weniger als ein neues Mainboard und die Erfolgschancen sind größer. Um zu wissen was genau für dich das beste wäre, wäre es hilfreich die Amperezahl deines NTs zu erfahren. (steht meistens neben +12V)