Wenn es nur darum geht, dass die störende Auswahl erscheint, kannst du auch die boot.ini deiner System-Partition editieren und dort den Eintrag von Win 2000 löschen oder timeout auf 0 setzen. Mit letzterer Einstellung könntest du auch noch Win2000 booten (wenn du es denn noch hättest), wenn du beim Booten F8 drückst.

fixmbr dürfte AFAIK gar nichts bringen, wenn eben nicht der Bootloader im MBR defekt ist. Wenn sich XP aber booten lässt, müsste der erste Bootloader im MBR noch funktionieren.