Das Problem hatte ich auch.
Lösung für Win2000/XP:
1. von Setup-CD booten
2. Wiederherstellungskonsole aufrufen (mit R-Taste)
3. "fixmbr" eingeben und bestätigen
4. neu booten ... fertig.

Lösung für Win98/ME:
1. von Startdiskette booten
2. fdisk/mbr eingeben
3. neu booten ... fertig.