Öhm ...

PHP-Code:
$variable = eregi_replace ('<!--BSP-KAT-Begin-->
<!--(.*)-->
<!--BSP-KAT-End-->', '\\1', $string); 
Jetzt mal als einfachste Lösung ... soweit ich dich richtig verstanden habe, sollte das ja funktionieren. Warum das jetzt extra zwischen solchen Kommentaren "gespeichert" werden muss, weiß ich auch nicht, aber naja, du wirst dir schon was dabei denken ...