Das es die einen Lieder findet und die anderen nicht kann ich mir irgendwie schwer vorstellen; und noch schwerer dass es an NTFS liegt, da es die zwei Lieder ja findet. Hast du denn auch wirklich rekursives scannen nach Musikdateien eingestellt(muss extra getätigt werden)?

Du könntest es als Lösungsversuch mal probieren deine Lieder auf eine seperate EXT2-Partition zu schieben. Windows soll mit Software von dritten dies lesen können(frag mich aber bitte nicht nach der Software, die das kann..). Oder das ganze per NFS freigeben und samba-Dienst einrichten, damit auch Mickeysoft was damit anfangen kann (nur da dann mit MySQL-Support anstatt SQLite, zweiteres hat Probleme mit dem auslesen über NFS).