Wenn du den huffyuv Codec benutzen willst, einfach unter google nach "huffyuv" suchen
Oder unter www.doom9.org nachschauen. Dort bekommst du jeden Codec.
Dass das Endvideo aus einzelnen Videos zusammengesetzt ist, ist egal. Schliesslich ist solche Programm dafür da
Welchen codec benutzt du denn zum Encoden.
Und welchen CPU hast du? Kann vielleicht sein, dass dein CPU dafür zu schwach ist (glaub ich zwar kaum, aber fragen kostet ja nichts ^^)