@ Riku
Stimmt net ganz.
Du kannst auch sagen: "Tokyo ni kaeru"
Genau so wie "Tokyo he kaeru"
Mann kann ja auch die passende Frage dazu stellen:
"Doko he kaeru no?" und "Doko ni kaeru no?"
Denke, dass es hierbei ziemlich egal ist welche Form benutzt wird.
Andersrum, bei aru/arimasu kann man kein "he" benutzen, sondern nur das "ni"

Schwerer wird's beim wa und ga.
Ich kann dir sagen, in welchem zusammenhang welches besser passt (sehr oft gehen aber auch beide), kann dir aber keine Brgründung nennen.
Grammatikalische Regeln kann ich dir leider nicht vortragen, da ich japanisch als Muttersprache gelernt habe und nicht durch einen Lehrer.