Hm, ich habe das jetzt mal durchgetestet, bei XP gibt es diesbezüglich keine Probleme. Es kann sein, dass die RPG_RT.exe Win98 damit einfach überfordert, und somit einen Fehler aufruft. Ich kann sogar zwei RPG_RT.exe gleichzeitig starten, und es gibt keinen Konflikt.

Demnach würde ich die Schuld auf das Betriebssystem schieben. *kratz* Das ist natürlich ärgerlich, wenn du da nicht mal das OS wechseln kannst, aufgrund des Speicherns von Daten.
Versuche diesbezüglich vielleicht eine Partition zu erstellen, auf der du alles abspeicherst, was wichtig ist. Wenn schon nicht mit CD-Rohlingen, dann mit einer Partition.