Du musst Ressourcen importieren (weil sonst die Gefahr besteht dass dein Projekt sich nicht mehr öffnen lässt). Wenn du das Chipset importierst kommt ein Dialog wo du die Transparenzfarbe wählen kannst (einfach draufklicken).
Wenn die Transparenzfarbe richtig ist, sollte eigentlich die Map auch richtig angezeigt werden. (Bei dir überdeckt der nichttransparente Upper Layer momentan den kompletten Lower Layer)