In der Datei bookmarks.html im Profilordner. Der Profilordner befindet sich unter Windows in %HOMEDRIVE%\Dateien und Einstellungen\%USERNAME%\Anwendungsdaten\Mozilla\Firefox\Profiles\Zeichensalat oder so. Ich bin mir beim Pfad nicht so ganz sicher, aber leider hab' ich gerade keinen Windows-Rechner zur Hand, um nachzusehen.