Wieso soll das nicht Sephiroths erster Körper gewesen sein? Er wurde einfach durch Mako konserviert.
Wann wechselt denn Sephiroth seinen Körper, der bleibt doch ständig gleich, mal abgesehen davon, dass es blos sein wandelnder Geist ist.

Das Auge in der "Mako-Wand" war wohl sehr eindeutig ein Weapon, das sollte das erwachen der Weapons darstellen. Es sieht ja auch wirklich wie das Auge einer Weapon aus.
Der Körper dort war der konservierte Körper von Seph.

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Es wurden zwar spirituelle Energien in mehreren Farben dargestellt, aber sie wurden alle grün, sobald sie Teil des LS wurden. Und bei Sep's Energie war das eben nicht der Fall.
Sephiroth ist doch noch kein Teil des Lebensstroms, warum sollte seine Energie dann grün sein?

Und ganz zum Schluss kämpft Cloud natürlich nicht gegen den echten Seph, das ist blos das letzt von ihm, was in Cloud geblieben ist, von dem er sich schließlich befreit.