Kannst du mal schreiben, welche Datei überhaupt gelöscht wird?
Ist bei dir vielleicht die Option "Virus Warning" im BIOS aktiviert? Die sollte bei einer Windows installation deaktiviert sein.
Oder hast du vielleicht eine völlig alte Virendefinition, dass der Virenscanner mit dem Heuristik-Scan meint, dass die Datei ein Virus ist, da evtl. die Datei eine andere Datei überschreibt.