nunja...
compilieren ist ein wenig was anderes... du meinst wohl eher encodieren, umcodieren, oder konvertieren.

allerdings kann man unter linux auch wmv dateien abspielen. ganze einfach mit xine öffnen und den passenden codec laden.
http://cambuca.ldhs.cetuc.puc-rio.br/xine/

und was das konvertieren anbelang, so findet man genug mit Google.

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zack