Die Installation von WinXP ist schlau genug dich zu fragen was er mit den einzeln Partitionen* machen soll. Du kannst ihm sagen, dass er nix machen soll, mit NTFS formatieren (würde ich dir empfehlen) mit FAT formatieren.

* Ich bin mir leider nicht sicher ob er dich fragt was er mit jeder Partition machen soll, oder nur bei der Partition wo er Windows installieren will. Auf jeden Fall kannst du aber einstellen, dass nur C formatiert wird und der restliche PC in Ruhe gelassen wird.

Wenn er dich nur nach C frägt, werden die anderen Partitionen standartmäßig einfach in Ruhe gelassen.