Ich komm leider nicht so richtig mit. Ich hab dein Text jetzt mindestens 5 mal gelesen. Ich versuch es mal auf meine Art zu erklären:
Also du hast folgende Laufwerke:

Primary:
Master: System HDD (Win XP)
Slave: DVD-ROM
(Oder andersrum)

Secondary:
Master: CD-RW
Slave: Maxtor HDD

So weit hab ich verstanden. Aber jetzt kommt der interessante Teil:
Das CD-RW wird mit dem Buchstaben D gekennzeichnet. Aber wenn du auf D klickst, erscheint dann im Explorer die Maxtor HDD. Aber als was wird die Maxtor HDD im Explorer angezeigt?
Ich würde mal vorschlagen, dass du mal in der Datenträgerverwaltung den Laufwerken neue Buchstaben verteilst. Vielleicht liegt dort der Fehler.
Dort gelangst du unter:
Start -> Einstellungen -> Systemsteuerung -> Verwaltung -> Computerverwaltung -> Datenträgerverwaltung