Nein, genau das ist ja das seltsame und leicht verwirrende daran:
Last Order läuft während des letzten Bandes von BAA, etwa ab dem Zeitpunkt, als der Doktor Alita in tausend Stücke zersprengt um sie nach Zalem zu schmuggeln. Die Handlung schildert das Zusammentreffen von Alita und den anderen Charakteren mit dem Abgeordneten Ladder, der den Professor in die Weltraumstadt Jeru eingeladen hat - ein Ereigniss, das in BAA seltsamerweise nicht dargestellt wurde.

Natürlich kann man "Last Order" auch als Alternativversion der Ereignisse in Zalem lesen, aber dann bleibt immer noch ungeklärt, warum Desty Nova und Alita sich in BAA niemals in der Weltraumstadt Jeru mit Ladder trafen.