Bevor du die System Partition löscht, denkt daran, wenn du sie löscht, löscht du auch die Boot.ini und die "ntldr" Datei.
DAnn hast du das problem, dass deine neue Widows auf einer andere Festplatte ist nicht mehr funktionieren....

Ich glaube, wenn ich ein betimmtes Partition löschen will, ziehe ich erstmal ein Backup. dann lösche ich die Partition, wo Windows drauf ist und dann formatieren.

Normalerweise brachst du nur die XP-CD uz booten. Nach dem Booten, steht dir formatieren und Partitionnen zu verfügung.

...hoffentlich hast du noch nicht gelöscht^^