Partition Magic läuft auch so, ohne FAT oder FAT32 Partition.
Ich benutze das Programm immer. Oder hast du vielleicht die Demo Version, bei der weiss ich es nicht. Wenn Partition Magic eine NTFS Platte bearbeiten soll, startet er den Rechner neu und startet eine Batch Datei, die alles regelt.

Viellecicht hilft auch dieses Programm, ich hab das zwar noch nie ausprobiert, ist aber kostenlos:

Acronis Partition Expert