Ich habe noch eine Theorie.
Vielleicht wurde diese Forschungsinsel von Esthar geschaffen, vom technischen her gut möglich, sie erschufen oder fanden Ultima Weapon und sahen das sie extrem stark war geradezu übermächtig. Sie versiegelten Ultima mit Bahamuts Hilfe (indem sie ihn in die Röhre steckten) und ließen die Forschungsinsel buchstäblich ans "Ende der Welt" bringen. Wo sie dann niemand finden sollte.